Timofeeva Sofya Vladimirovna

Публикации автора:

1. Association of rs920778 HOTAIR with risk of breast cancer: meta-analysis
   Резюме Abstract | Скачать
   Мета анализ был направлен на оценку связи между полиморфизмом rs920778 HOTAIR и риском развития рака молочной железы на основе анализа данных четырех исследований случай-контроль. Поиск опубликованных исследований случай-контроль проводили в базах данных PubMed и Google Scholar. Ассоциация оценивалась по статистическим критериям отношению шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи полиморфизма rs920778 и риском развития рака молочной железы в мета анализ были включены 4 публикации (четыре исследования) с выборкой из 1347 пациентов с раком молочной железы и 1366 условно-здоровых лиц в контрольной группе. В результате исследования мы не обнаружили связь между rs920778 и риском развития рака молочной железы. Результаты, полученные при анализе данных во всех генетических моделях: гомозиготная (ОШ = 1,78, 95% ДИ: 0,72 – 4,36, Pz = 0,21, Pi2 = 0,0001), гетерозиготная (ОШ = 1,15, 95% ДИ: 0,68 – 1,96, Pz = 0,60, Pi2 = 0,00001), доминантная (ОШ = 1,00, 95% ДИ: 0,65 – 1,53, Pz = 0,99, Pi2 = 0,0001), рецессивная (ОШ = 1,62, 95% ДИ: 0,74 – 3,52, Pz = 0,23, Pi2 = 0,0002), аллельная (ОШ = 1,24, 95% ДИ: 0,80 – 1,92, Pz = 0,33, Pi2 = 0,00001). Настоящий мета анализ показал, что полиморфизм rs920778 HOTAIR не связан с риском развития рака молочной железы среди населения Азии. Для подтверждения потребуются дополнительные исследования.
2. Association of PPARG polymorphism rs1801282 with the risk of atherosclerosis development: Meta - analysis
   Резюме Abstract | Скачать
   Метаанализ был направлен на оценку связи между полиморфизмом rs1801282 гена PPARG и риском развития атеросклероза на основе анализа данных 20 исследований случай-контроль. Поиск опубликованных исследований случай-контроль проводили в базах данных PubMed, Web of Science и Google Scholar в период с 2000 года до февраля 2022 года. Ассоциация оценивалась по статистическим критериям отношению шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи полиморфизма PPARG Pro12Ala и риска развития атеросклероза в мета-анализ были включены 20 публикаций (двадцать исследований) с обширной выборкой 8691 случай и 11817 контролей. В целом результаты показали, что аллель Ala была связана с повышенным риском атеросклероза в азиатской популяции p=0,01, ОШ = 2.06, 95% ДИ 1.16 - 3.65; p=0,02, ОШ = 2.02, 95% ДИ 1.14 - 3.59  по сравнению с европейской популяцией. Объединенные коэффициенты риска атеросклероза на основе доминантных, рецессивных, аллельных, гомозигогтных и гетерозиготных моделей полиморфизма rs1801282 PPARG составили (p=0,96, ОШ = 1.00, 95% ДИ 0.87 - 1.15; p=0,13, ОШ = 1.21, 95% ДИ 0.95 - 1.53; p=0,88, ОШ = 1.02, 95% ДИ 0.82 - 1.26; p=0,06, ОШ = 1.26, 95% ДИ 0.99 - 1.61; p=0,53, ОШ = 0.96, 95% ДИ 0.83 - 1.10), соответственно. Настоящий мета-анализ показал, что полиморфизм rs1801282 C/G PPARG может быть связан с риском развития атеросклероза среди населения Азии. Для подтверждения наблюдаемой связи потребуются дополнительные исследования.
3. Распространенность микро РНК в интронах и окрестностях генов CGA, FSHB, LHB, TSHB у млекопитающих с формированием различного числа доминирующих фолликулов
   Резюме Abstract | Скачать
4. Collection of samples of tumor, healthy tissues and blood samples of patients with gastric cancer in the biobank of the National Medical Research Center for Oncology - a resource for potential molecular genetic studies
   Резюме Abstract | Скачать
   Рак желудка (РЖ) во всем мире является одним из самых распространенных видов этого заболевания. Из-за его запоздалой диагностики, а также высокой гетерогенности данного заболевания, прогноз для пациентов на сегодняшний день остается неудовлетворительным. Поэтому очень важно проводить молекулярно-генетические исследования, направленные на поиск новых биомаркеров – предикторов заболевания, которые позволят не только изменить подход к скринингу РЖ, но также предсказывать чувствительность пациентов и прогноз при раке желудка.С целью проведения потенциальных молекулярно-генетических исследований, на базе биобанка ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России была сформирована коллекция образцов опухолевых и условно-здоровых тканей, а также образцов крови, полученных от больных РЖ, получавших лечение в центре. В период с января 2021 по сентябрь 2022 год был произведен забор 692 образцов опухолевых и условно-здоровых тканей, а также 318 образцов крови от 173 пациентов. Средний возраст пациентов на момент забора материала составил 62,3±0,79 года. Образцы помещены в криохранилище биобанка для долгосрочного хранения при температуре -196°С. Информация о пациентах, а также вся клиническая информация хранится в деперсонализированном виде.Имеющаяся коллекция образцов опухолевого материала, а также образцов крови пациентов с РЖ, в сочетании с клинической информацией, ассоциированной с имеющимися образцами, является ценным ресурсом для фундаментальных исследований.
5. Experience in obtaining a multicomponent three-dimensional cellular model of tumor growth for molecular genetic studies of breast cancer
   Резюме Abstract | Скачать
   АннотацияРак молочной железы остаётся актуальной проблемой современного здравоохранения во всём мире. Разработка новых эффективных противоопухолевых средств опирается на in vitro модели, максимально приближенные к опухоли in situ по своим молекулярно-генетическим свойствам. По общему представлению, в перспективной клеточной модели должны воспроизводиться ключевые элементы микроокружения опухоли, а также наблюдаемые в опухоли градиенты газов и питательных веществ. Данным требованиям отвечают многокомпонентные трёхмерные клеточные модели опухолевого роста, получившие широкое распространение в экспериментальной онкологии. Несмотря на значительное количество существующих примеров реализации таких моделей, проблема поиска экономически выгодных технологических решений, способных предоставить материал для как можно более широкого спектра исследований – от молекулярных до гистологических, остаётся актуальной. В данной работе нами протестирован адаптированный метод висячей капли для получения многокомпонентной трёхмерной модели опухолевого роста рака молочной железы, представляющей собой сфероид из клеток рака молочной железы BT20, заключенный в коллагеновый сгусток с фибробластами. Новизна работы заключается в последовательном введении компонентов модели непосредственно в каплю в отличие от более распространённых подходов, предполагающих перенос клеточных агломератов и их заключение в биогели. Предлагаемое нами техническое решение основывается на применении покрытия из СИЭЛ 159-330, способствующего ускоренному формированию агломератов в висячей капле – свойства, необходимого для облегчения замены среды. Полученные в ходе работы конструкты обладали гистологическим сходством с опухолью in situ однако нам не удалось добиться контактного взаимодействия между клетками опухоли и микроокружением.