Гены антибиотикорезистентности (АРГ) являются новыми поллютантами, а донные отложения озер были признаны важным резервуаром и горячей точкой распространения АРГ. Присутствующие в донных отложениях озер АРГ могут попадать в вышележащие воды и проникать в грунтовые воды из-за изменений окружающей среды и внешних воздействий. В данной работе были изучены десять АРГ, включая гены устойчивости к макролидам (ermB и mphA), сульфониламидам (sul2), тетрациклину (tetO), карбапенемам (blaVIM), ванкомицину (vanA, vanB), аминогликозидам (aadA2), метициллину (mecA), цефалоспоринам и монобактамам (blaCTX-M), интегроны классов 1-3 (intI1, intI2, intI3) и бактериоценоз донных отложений оз. Маныч-Гудило. Было отмечено наличие всех 10 исследованных АРГ, а также интегронов двух классов (intI1 и intI3). Количество копий АРГ в донных отложениях можно расположить в следующем порядке по убыванию: blaCTX-M > sul2 > aadA2 > blaVIM > vanB > tetO > ermB > vanA > mphA > mecA. На уровне родов преобладали Streptococcus (8,55 %), неопределенный род семейства Rhodobacteraceae (6,25 %), неопределенный род порядка Bacteroidales (5,03 %). Доминирующими типами являлись Proteobacteria (38,80 %), Bacteroidetes (19,75 %) и Firmicutes (11,85 %). С использованием функциональной аннотации прокариотических таксонов (FAPROTAX) было определено наличие 41 функциональной группы. Большая доля таксонов относилась к таким функциональным группам, как хемогетеротрофы, аэробные хемогетеротрофы, а также группы, принимающие участие в цикле серы.
